Nature：发布首个人类X染色体完成图，开启基因组学研究者新纪元

美国国立卫生研究工作院（NIH）的的总部国家人类文明线粒体研究工作所（NHGRI）的研究工作医护人员早就生产出人类文明线粒体的第一个端对端DNA碱基。近来发表在《Nature》杂志上的就其研究工作报告暗示，研究工作医护人员有似乎降解一个可靠的人线粒体逐个碱基碱基，这将加快人线粒体完备碱基的换用。

NHGRI主任、医学博士Eric Green说：“这项研究工作开启了线粒体学研究工作的新纪元。尽似乎降解显然完备的线粒体和线粒体碱基的并能是一项系统设计现职，将有助于我们全面洞察线粒体机制，并为医学护理中所线粒体的资讯的应用于备有的资讯。”

2003年，研究工作医护人员首次完成了人类文明线粒体的核酸工作。随着研究工作的不断深入和系统设计的不断进步，人类文明线粒体被选为有史以来最可靠和最完备的脊椎动物线粒体碱基。然而，目前仍然存在数百个推断出的缺口或缺失的DNA碱基，其中所包含着难以辨识的每一次DNA录像，似乎覆盖了与人类文明肥胖症和病因有关的DNA和其他机制元件。

人类文明线粒体中所分之一有60亿个碱基，而DNA核酸仪很难一次全部存储。因此，研究工作医护人员将线粒体切成更大的录像，然后分析方法每个录像，一次诱发数百个碱基的碱基，并将这些较短的DNA碱基重新组合。

在这项研究工作中所，研究工作医护人员首先选用了X线粒体碱基完成核酸，因为它与无数的X线粒体病因就其，之外糖尿病，慢性肉芽肿病和彭氏脊髓营养不良症等。

不过，研究工作医护人员很难对正常人类文明肝细胞的X线粒体完成核酸，而是应用于了一种有两个有所不同的X线粒体的类似于肝细胞类型。与仅具有X线粒体单拷贝的未成年肝细胞相比，这种肝细胞可备有更多的DNA完成核酸。它还可以避免分析方法典型女性肝细胞的两个X线粒体时遇到的碱基差别解决办法。

图像描绘了DNA碱基的拼图破洞。幻灯片来源：Ernesto del Aguila III（NHGRI）

借助新的核酸系统设计和分析方法方式，研究工作医护人员对人类文明X线粒体完成了分析方法，随后用新开发的计算机程序组装降解了碱基的许多录像，并尽力缩小X线粒体上最大的剩余碱基缺口，这是在线粒体中所间大多（着丝粒）推测的分之一300万个每一次DNA碱基。

由于很难可供评核组装这种高度每一次的DNA碱基准确性的方式，研究工作医护人员执行了几个检验两步以帮助确认所降解碱基的有效性。

该报告的作者Karen Miga博士说：“我们其实线粒体中所这些基本上推断出的位点在个体之间是非常不同的，但是重要的是开始确信这些差别如何导致人类文明免疫学和病因。”

据悉，这项研究工作是Telomere-to-Telomere (T2T) consortium计划的一大多，该计划由NHGRI大多支助，宗旨诱发人类文明线粒体的完备参考碱基。目前，T2T正在继续努力处理剩余的人类文明线粒体，以期在2020年诱发完备的人类文明线粒体碱基。

原始出处：

Karen H. Miga, Sergey Koren, Adam M. Phillippy, et.al. Telomere-to-telomere assembly of a complete human X chromosome. Nature 14 July 2020