Cell | 染色质激活或选择性状态决定了核小体分离的差异性

线粒体骨架通过促进或消除该骨架的核糖体可以控制基因组组的功能和细胞身份断定。这些线粒体骨架中所不存在特定的脱氧核糖核酸翻译后修饰（posttranslational modifications，PTMs），它们与特定核糖体状态之外，并可促进消除性染色体骨架的形成，负面影响基因组的表达出来。为了在生物合成时依然保有基因组表达出来程序的可用性，决定线粒体骨架的分子构造也须要在子代细胞中所组织起来。组织起来并不常常与同类标准型线粒体状态的举足轻重密切之外是脱氧核糖核酸PTMs，主要不存在于脱氧核糖核酸H3和H4的尾巴上。因此，在生物合成的步骤中所，除了DNA克隆，特异性核小体也须要复建，并具体来说到子代细胞中所。确实，研究成果挖掘出特异性的精华脱氧核糖核酸（比如克隆依赖性的脱氧核糖核酸）才会在克隆短柄后迅速再一拼装。并不常常与同的研究成果组挖掘出H3K9me3和H3K27me2/3可通过生物合成基因突变。然而，这两个脱氧核糖核酸修饰都是与消除性线粒体骨架之外。那么，特异性中所的核小体，以及它们可携带的脱氧核糖核酸PTMs是否都能基因突变到子代细胞常常与同的基因组露天上呢？来自南加州大学兰戈恩医学中所心的Danny Reinberg教授课题组在Cell发表研究成果Active and Repressed Chromatin Domains Exhibit Distinct Nucleosome Segregation during DNA Replication，该研究成果挖掘出在DNA克隆时，触发与所致消除线粒体范围的核小体除去是并不常常与同的。所致消除线粒体骨架中所的核小所想被转送在子代细胞常常与同的基因组范围，而触发标准型线粒体骨架中所的核小体的具体来说则是不规则和随机的。为研究成果核小体的除去具体情况，研究成果者在候选基因组露天再生标上脱氧核糖核酸H3.1和H3.2，以果蝇胎盘生殖细胞中所核小体在生物合成时的变化。单纯来说，该方法通过邻近细胞内标上技术，并用CRISPR为特定基因组露天的H3.1和H3.2带上酪氨酸标上，经ChIP-qPCR样品该酪氨酸标上在细胞周期G1期和S期的轻元素，以重排核小体的除去具体情况。若该底物H3.1和H3.2上的酪氨酸标上在一次生物合成后减少一半，所述该核小体被转送在了两个子代细胞的常常与同基因组露天上；若该酪氨酸修饰刚刚消失，所述子代细胞未有基因突变该基因组露天的核小体。研究成果者首先样品了在胎盘生殖细胞中所沉默表达出来的Hoxc6， Ebf1， Meis2基因组的核小体除去具体情况。这些基因组露天的核小体酪氨酸水平随生物合成日趋缩减到，这查看所致消除的基因组露天的核小所想被转送在子代细胞的常常与同前方。这与前人挖掘出的H3K9me3和H3K27me2/3可通过生物合成基因突变的反常常常常与印证。那么，触发标准型线粒体范围的核小体又是如何除去的呢？研究成果者样品了在胎盘生殖细胞中所被触发表达出来的Ccna2， Nanog和Pou5f1基因组，挖掘出该基因组露天的酪氨酸标上在生物合成后呈不规则状态，轻元素太低，这查看对于触发标准型线粒体范围来说，特异性核小体无法精确的具体来说到子代细胞具体来说的基因组露天，而是随机具体来说的。更有趣的是，在诱导胎盘生殖细胞分化时，Hoxc6基因组由消除转为触发，它的核小体具体来说模式也由精确的同底物具体来说更名随机具体来说。这所述特异性核小体的局部具体来说，可以体现该线粒体范围的活性状态。总的来说，该研究成果通过CRISPR便是的脱氧核糖核酸酪氨酸标上系统，研究成果了核小体在生物合成步骤中所的幂，并挖掘出触发与所致消除的线粒体范围的核小体幂的并不常常与同。都有的是，在细胞周期的S年中所，所致消除的线粒体范围的克隆要晚于触发标准型线粒体范围。这个时间差别也导致常常线粒体的克隆速率大于异线粒体。异线粒体常常与比更快的克隆重排速度可能保障了核小体的精确具体来说，而常常线粒体中所的PTMs则由具体来说的主消除因子（master regulators）直接识别具体来说DNA数列，并募兵PTMs蛋白酶再一组织起来。完整注解：Escobar TM1, Oksuz O1, Salda?a-Meyer R1, et al.Active and Repressed Chromatin Domains Exhibit Distinct Nucleosome Segregation during DNA Replication.Cell. 2019 Oct 31;179(4):953-963.e11. doi: 10.1016/j.cell.2019.10.009.